财经战略研究院的前身为财政与贸易经济研究所。2011年12月，作为中国社会科学院实施哲学社会科学创新工程的一个重大举措，以财政与贸易经济研究所为基础，组建综合性、创新型国家财经战略研究机构——财经战略研究院。财经战略研究院设有综合经济战略研究部、财政研究室、税收研究室、成本与价格研究室、流通产业研究室、国际贸易与投资研究室、服务贸易与WTO研究室、电子商务研究室、服务经济研究室、城市与房地产研究室、旅游与休闲研究室、财政审计研究室等12个研究室，公开出版刊物《财贸经济》和《China Finance & Economy》。
　　财经战略研究院博士后流动站建于1995年，是社科院较早建立博士后流动站的单位之一。现有博士后合作导师17人。具有博士后招收资格的一级学科有两个，分别为应用经济学和工商管理，涵盖财政学、产业经济学、国际贸易学、金融学、旅游管理等五个二级学科。
　　财经战略研究院自建站以来，已累计招收博士后研究人员204人。其中国家资助博士后34人，约占招收总数的16.7%；项目博士后（含自筹经费博士后）154人，约占75.5%；工作站联合招收16人，约占7.8%。在社科院博管会的支持下，近年来，财经院的招收规模总体呈扩大趋势。截至目前，已有123人期满出站，其中八人留院工作。这些留院博士后为我院科研工作注入了新鲜血液，促进了我院相关学科的发展，提高了科研成果的数量和质量。此外，出站博士后大部分去往高校和科研院所，部分去往政府机关和企业等。他们当中，大部分人已被评为研究员、副研究员，成为各单位的学术带头人，有的在行政岗位上担任了司局级等重要领导职务。
　　财经战略研究院十分重视博士后的学术交流，2011年与院博士后管理委员会共同承办了以“把握时代脉搏，共筑财经前沿”为主题的“首届中国财经科学博士后论坛”，并出版了一期《财贸经济》专刊，收录优秀的博士后论坛征文。此次论坛在全国财经领域产生了较大的影响，提高了社科院以及财经院的影响力。
　　在2010年全国博士后工作评估中，财经战略研究院应用经济学博士后流动站荣获“全国优秀博士后流动站”称号。